近期，生物醫(yī)學(xué)研究中心病毒遺傳與基因工程團(tuán)隊(duì)在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Virulence（農(nóng)林科學(xué)1區(qū)）發(fā)表題為“Mapping evolutionary paradigm of Oropouche virus driven by dinucleotide bias and context-dependent codon bias”的學(xué)術(shù)論文。該論文從OROV病毒核苷酸不同組合形式所蘊(yùn)含的蛋白遺傳特征進(jìn)行了較為系統(tǒng)的闡述，為進(jìn)一步了解這些主要蛋白在OROV病毒生命周期中所發(fā)揮的生物學(xué)作用提供了新思路。
奧羅普切熱病毒（Oropouche virus，OROV）是布尼亞病毒科（Peribunyaviridae）的成員之一，通過(guò)庫(kù)蠓和蚊蟲(chóng)叮咬傳播疾病，可以引起宿主突發(fā)高熱、頭痛、肌肉痛等。本文以45個(gè)不同基因型的OROV毒株為研究對(duì)象，評(píng)估核蛋白、糖蛋白和RdRp蛋白演化的選擇壓力。信息熵、二核苷酸比值比、相對(duì)同義密碼子使用值和情境依賴(lài)密碼子偏差來(lái)闡明與單核、二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸組成相關(guān)的遺傳特征。整體核苷酸使用偏差、二核苷酸偏差和同義密碼子使用偏差的程度與基因型特異性模式無(wú)關(guān)，而是在三種蛋白質(zhì)中表現(xiàn)出蛋白質(zhì)功能依賴(lài)的模式。盡管二核苷酸偏嗜性和同義密碼子使用偏嗜在相對(duì)寬范圍內(nèi)變化，但二核苷酸CpG、強(qiáng)偏嗜性同義密碼子以及CDCB仍強(qiáng)烈受宿主和病毒生命周期的自然選擇壓力影響。此外，密碼子的使用模式，如有效密碼子數(shù)量所示，表明OROV核蛋白在其進(jìn)化模式中受到更強(qiáng)的選擇壓力，而糖蛋白和RdRp主要受自然選擇和突變壓力影響。
生物醫(yī)學(xué)研究中心病毒基因工程團(tuán)隊(duì)副教授周建華為論文通訊作者，博士研究生楊宣葉與碩士研究生劉澤煜為論文共同第一作者。該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金經(jīng)費(fèi)的支持。
文章鏈接：DOI: 10.1080/21505594.2025.2600128
